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科技服務 CLIP—Seq
表觀遺傳學研究服務-CLIP—Seq

紫外交聯免疫沉淀 (crosslinking-immunprecipitation, clip) 結合高通量測序,即CLIP-Seq又稱為HITS-CLIP。是一項在全基因組水平揭示RNA分子與RNA結合蛋白相互作用的革命性技術。


其主要原理是基于RNA分子與RNA結合蛋白在紫外照射下發生耦聯,以RNA結合蛋白的特異性抗體將RNA-蛋白質復合體沉淀之后,回收其中的RNA片段,經添加接頭、RT-PCR等步驟,對這些分子進行高通量測序,再經生物信息學的分析和處理、總結,挖掘出其特定規律,從而深入揭示RNA結合蛋白與RNA分子的調控作用及其對生命的意義。

 

技術優勢
 
1) 全轉錄組范圍內研究RNA結合蛋白和RNA相互作用網絡
2 活細胞原位研究RNA結合蛋白和RNA相互作用
3 通過紫外交聯可以加強RNA結合強度,從而可以鑒定到實際結合的短序列
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